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Plateforme Bio2Mar
Biodiversité et Biotechnologies Marines

Biodiversité Biologie Moléculaire

 

  •  Extracteur ADN ARN Protéines, Maxwell 16MDx Instrtument AS3000

Le Maxwell 16 MDx permet d'extraire et de purifier ADN, ARN et protéines de manière automatisée. 16 échantillons peuvent être traités en un seul run. Celui-ci dure de 30 à 45 minutes. Le principe est la fixation des molécules sur des particules paramagnétiques. Les volumes d'élution vont de 25µl à 400µl. Il est équipé d'UV pour la décontamination.

Avantages :pas d'utilisation de pointes, pas de risque de colmatage.Pas de gouttes, pas de contaminations entre échantillons. Reproductibilité. Versatilité. Exposition minimale à des produits dangereux.

Exemples d'utilisation : Extraction d'ADN sur de souches de bactéries, sur de colonies dans du bois, sur des plastiques. Extraction d'ARN d'algues, de glandes pinéales de poissons, d'oeufs et embryons d'oursins.

 


 

  •  Séquençeur 16 capillaires, Analyseur de fragments, 3130XL ABI

Séquençage Sanger, analyse de fragments, empreintes génétiques (T-RFLP)

 

 

  •  Bioanalyseur ADN, ARN, protéines et cellules, Agilent 2100

Contrôle qualité d'ARN (RIN), analyse de fragments d'ADN, analyse de protéines et analyse de fluorescence de cellules en cytométrie de flux.

Avantages : analyse des données, précision, reproductibilité des données, faible durée d'analyse (30 minutes), consommation minimale d'échantillon (1à 4µl), exposition minimale à des produits dangereux. 12 échantillons en un run.

 

 

  •  Machine de PCR en temps réel, StepOnePlus ABI
Le système de PCR en temps réel StepOnePlus ™ permet la lecture en plaques 96 puits. Intuitif, il est doté de logiciles d’analyse de données et de logiciels de contrôle de l'instrument. Il fournit des résultats quantitatifs précis pour une variété d'applications de recherche en génomique (dosages SybrGreen, TaqMan®…).

 

  •  5 Machines de PCR, 4 Veriti ABI (0.1 et 0.2ml), 1 GeneAmp ABI 2700

Les thermocycleurs sont dotés d’un écran tactile pour une utilisation intuitive et d’un processeur rapide qui réduit la durée de chaque cycle. Ils peuvent permettre de régler indépendamment la température des 6 blocs dans un même run.


 

  •  Scanner laser de quantification de protéines, acides nucléiques et autres biomolécules, Typhoon FLA9000 Scanneur

Typhon FLA 9000 est un scanner laser polyvalent pour l’imagerie biomoléculaire, dans des applications telles que :
• mesures quantitatives et qualitatives de radioisotopes
• Electrophorèse 2-D DIGE
• Western Blot (ECL ™ Plus) chimiofluorescent
• Western Blot (ECL Plex™)
• fluorescence infrarouge proche
• gels d’électrophorèse coloré au bleu Coomassie ™ ou à l’ argent 

  • Ultracentrifugeuse, OPTIMA MAX XP

Pilotage par écran LCD

Pour des microtubes

Vitesse maximale : rpm 150.000 - RCF (xg) 1.019.000

Gamme température : 0°C à 40°C, incrémentation par 1°C

 

 

  • Electrophorèse 1D, ETTAN IPGPhor 3

 

 

  • Electrophorèse 2D, ETTAN DALT Six

Utilise des formats larges de gels polyacrylamide (26 X 20cm) en 4-5h.

 

  • Station de travail automatisée, Biomek 3000

Permet d’automatiser des manipulations de liquide en plaque 96 puits pour des applications telles que des purifications de produits PCR et de réactions de séquençage, des purifications de plasmides, des réactions de PCR, de qPCR…

 

  • Fluorimètre, Quantus Fluorometer 

Double canal de fluorescence pour la quantification d’ADN, d’ARN et de protéines.

Haute sensibilité de détection : DNA 10pg/µl et ARN 100pg/µl

Rapide et simple d’utilisation (calibrations sauvegardées)

 

  • Homogénéiseur, FastPrep-24 ™ 5G 

Développé pour lyser les échantillons difficiles et résistants. Il broie, homogénéise et lyse de façon complète et rapide tous les tissus et cellules permettant un isolement et une purification faciles et reproductibles de l'ARN stable, des protéines actives et de l'ADN génomique complet. 48 échantillons peuvent être traités en 40 secondes. Il peut être équipé d’un bloc froid. Caractéristiques : autonome, piloté par logiciel, écran tactile convivial, mouvement alternatif à grande vitesse, temps de traitement courts, programmation intuitive, protocoles automatisés.

  • Ordinateur portable équipé de logiciels:
  1. d'analyses et de statistiques, Primer 6
  2. d'analyses de fragments, empreintes génétiques, GeneMapper

 

 

  •  En ligne : Logiciel d'assemblage et alignement de séquences, CodonCode Aligner

 

 

 

 

 

Claire Fayet - 14/03/17

Traductions :